男性极少发生尿路感染，女性易感这与女性特殊的生理结构有关，应根据它的部位和类型分别给予不同的治疗。对于首次发生的尿路感染应立即用抗菌素进行短程治疗，一般用药7--14天为1个疗程。对于经常复发的尿路感染也应使抗菌素治疗，但应考虑用长疗程低剂量的方法进行治疗并辅助使用一些中药药物治疗降低抗菌素对身体的伤害。
选用抗菌素应参照的标准：在尿细菌培养结果出来之前，可先试用复方新诺明、呋喃坦啶、氟哌酸或氨苄青霉素等；对较严重的尿路感染，可以选择两种抗菌素联合用药；避免使用对肾脏有毒性作用的抗菌素，如庆大霉素、卡那霉素、丁胺卡那霉素、妥布霉素、多粘菌素等。
